医学超声图像处理(一)---数据集
该数据集包括在 2018 年和 2019 年期间获得的 162 个心尖 4 腔 (A4C) 视图二维超声心动图 (echo) 记录的集合.用于检测心脏左心室 (LV) 壁上的心肌梗塞(心脏病发作). 视频来自一年内执行的 10, 000 多个检查, 其中包括 800 多例因急性 ST 段抬高心肌梗死 (MI) 入院的病例. HMC-QU 数据集中包含的回声属于 93 名 MI 患者(均为首次和急性
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数据集
最近在做有关超声的项目,整理了一下公开超声数据集
1、超声心动图数据集
CAMUS
包含 500 个病例,涵盖 2D 心尖二腔和心尖四腔视图视频,且所有帧都有标注,可用于超声心动图图像分割等任务的研究
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EchoNet-Dynamic
拥有 10,030 个 2D 心尖二腔视图视频,每个视频以积分形式提供左心室面积,仅标注了舒张末期和收缩末期的相位,适用于对左心室功能分析等相关研究
需先同意斯坦福大学医学院的研究使用协议
链接: link (这两天突然404了,不知道为什么)
HMC-QU
该数据集包括在 2018 年和 2019 年期间获得的 162 个心尖 4 腔 (A4C) 视图二维超声心动图 (echo) 记录的集合.用于检测心脏左心室 (LV) 壁上的心肌梗塞(心脏病发作). 视频来自一年内执行的 10, 000 多个检查, 其中包括 800 多例因急性 ST 段抬高心肌梗死 (MI) 入院的病例. HMC-QU 数据集中包含的回声属于 93 名 MI 患者(均为首次和急性 MI)和 69 名正常(非 MI)受试者
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CardiacUDA
每例患者在扫描过程中接受了 4 个视图,包括胸骨旁左心室长轴 (LVLA) 、 肺动脉长轴 (PALA)、 左心室短轴 (LVSA) 和心尖四腔心脏 (A4C),导致每位患者有 4 个视频。每个视频的分辨率为 800x600 或 1024x768
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CardiacNet-PAH 和 CardiacNet-ASD。
从四家合作医院收集数据集。为保证所有超声心动图视频均符合标准,每个病例都由5-6名经验丰富的医生收集、注释心尖四腔心脏 (A4C) 视图的视频。CardiacNet-PAH 由 507 例用于肺动脉高压 (PAH) 分类的病例组成,通过右心导管测量访问和批准患者的诊断。在 CardiacNet-ASD 中,有 243 例用于房间隔缺损 (ASD) 分类的病例由经验丰富的医生诊断和注释。每个视频的分辨率为 800×600 或 1024×768,具体取决于扫描仪的类型(飞利浦或 HITACHI)。总共收集了 750 个视频,每个视频由 100 多帧组成,至少覆盖两个心跳周期。我们还收集了心脏结构的像素级注释用于重建评估,包括 A4C 视图中左心室 (LV) 、右心室 (RV)、左心房 (LA) 和右心房 (RA) 的掩码。为每个视频提供 5 个帧的像素级注释掩码。
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EchoCP
用于卵圆孔未闭诊断的造影剂经胸超声心动图数据集
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区域室壁运动评估数据集
数据集由 198 名患者组成,其中每位患者有三种模式(2D 模式、MCE 模式和 LVO 模式)的三个视图(A4C、A3C 和 A2C)。因此,共有 1,782 个超声心动图视频,帧大小为 640480(71-510)。共收集 3 种模态的超声心动图图像 9881 帧,其中 2D 模式、LVO 模式和 MCE 模式分别为 3,091、3,391 和 3,399 帧。对于每个视频,选择六帧(两个收缩末期帧、两个舒张末期帧以及舒张末期和收缩末期帧之间的两个帧)进行注释,并标记左心室的区域壁轮廓。所有 198 例患者共标记 3,564 个节段,其中 45 个节段异常。所有标签均由四名经验丰富的超声医师注释
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超声心动图的数据可以关注一下:
链接: link,link,有很多比较好的数据集
2、乳腺超声数据集
BreastUltrasoundImagesDataset
包含了乳腺超声图像,可用于乳腺结节分割、乳腺肿瘤分割等研究.包括25 至75 岁女性的乳腺超声图像。此数据于 2018 年收集。患者人数为 600 名女性患者。该数据集由 780 张图像组成,平均图像大小为 500*500 像素。图像为 PNG 格式。这些图像分为三类,即正常、良性和恶性。
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3、胆囊癌超声数据集
GBCU
GBCU是第一个从超声图像中识别胆囊癌的公共数据集。GBCU共包含218例患者的1255张带注释的腹部超声图像(432张正常,558张良性,265张恶性)。218例患者中,正常、良性、恶性分别为71例、100例和47例。训练集和测试集的大小分别为1133和122。
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GBUSV
GBUSV是一个未注释的数据集,由恶性或非恶性胆囊患者的超声视频组成。视频序列的长度从43帧到888帧不等。该数据集由32个恶性视频和32个非恶性视频组成,分别包含12,251帧和3,549帧。视频帧从中心裁剪,以匿名化患者信息和注释。处理的帧大小为360x480像素。
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4、脑部肿瘤超声
Intra-operative Ultrasound (iUS) images,术中超声
对于每个临床病例,提供的数据为:
术前 3T MRI 图像,包括增强 T1w 和 T2 FLAIR 扫描。
术中超声(iUS)图像,作为覆盖开颅手术后的整个肿瘤区域。术中超声三个手术阶段(切除前、切除中和切除后)的体积提供。
术前 iUS 和切除术中脑肿瘤的分割切除期间和手术后 iUS 的空洞
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5、颈动脉超声
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6、腹部超声
从11 名没有任何腹部病变或已知疾病的受试者那里获得的(40% 是女性,60% 是男性,年龄 = 27±3 岁)。该流程是常规的腹部超声检查,遵循相应的采集方案(检查前禁食 9 小时)。
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7、甲状腺超声
DDTI(良性和恶性病例进行分类)
该数据库包含99例病例和134幅图像。每个病例都以包含专家注释和患者信息的XML文件的形式呈现。每月新增病例将随附相关信息上传。
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甲状腺超声结节
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8、血管瘤超声图像
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9、胎儿肺超声图像
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完

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