Galaxy:生信数据分析的效率革命
整合超1万+工具,覆盖基因组、转录组、单细胞、蛋白质组、癌症基因组等全领域分析。:请在本文后留言,表明要进交流群,然后加微信 usegalaxy 为好友,拉你进群。(如Verkko、Hifiasm混合组装),攻克高重复基因组难题。优先技术响应、定制化工具部署、阶梯式能力培养,请加入「Galaxy生信星球」。:自动计算变量分布、统计检验,输出出版级三线表(Table 1);:Circos圈图绘制功能
你是否曾因生信分析的高门槛而却步?是否在软件安装和环境配置中耗尽耐心?Galaxy生物信息云平台正以零代码、全流程、可重复的特性,掀起一场生信分析的效率革命!
Galaxy是什么?
Galaxy是一款开源的在线生信分析平台,整合超1万+工具,覆盖基因组、转录组、单细胞、蛋白质组、癌症基因组等全领域分析。它通过浏览器即可操作,无需本地安装软件,彻底摆脱“依赖环境崩溃”的噩梦!其核心优势包括:
-
• 零编程门槛:拖拽式操作界面,图形化工具调用;
-
• 全流程自动化:从数据上传、质控、比对到可视化一键完成;
-
• 结果可重复:自动记录分析步骤与参数,支持历史记录共享;
-
• 云端算力支持:免费100G存储空间,轻松处理海量数据。
三大核心应用场景
1️⃣ 组学数据分析
-
• 转录组分析:支持RNA-seq全流程(如Hisat2比对→featureCounts定量→DESeq2差异分析);
-
• 单细胞数据分析:Seurat, Scanpy 等主流单细胞分析工具任意选择;
-
• 变异检测:集成GATK、FreeBayes等工具,适用于癌症基因组研究。
2️⃣ 临床与可视化
-
• 临床基线表生成:自动计算变量分布、统计检验,输出出版级三线表(Table 1);
-
• 高级可视化:Circos圈图绘制功能,复现染色体变异、拷贝数变化等复杂图谱。
3️⃣ 教学与协作
-
• 教学神器:内置Galaxy Training教程库,覆盖从入门到高阶的实操案例;
-
• 一键分享:历史记录可生成链接或公开发布,协作评审零障碍。
实战案例
一键分析 Bulk 转录组数据
一键分析单细胞数据
一键分析 ChIPseq 数据
一键分析 WES 数据
一键 snippy 分析数百上千个样本
用户自行创建工作流
未来:AI融合与超长读长支持
Galaxy正整合ONT超长读长技术与深度学习工具(如Verkko、Hifiasm混合组装),攻克高重复基因组难题。其目标是成为全物种参考基因组生产的自动化引擎,推动地球生物基因组计划(EBP)的实现!
结语
Galaxy不仅降低了生信分析的门槛,更重塑了科研协作模式——让生物学者回归科学问题本身,而非困于技术泥潭。正如用户所言:“一杯咖啡的时间,走完曾经一周的流程☕️”。
立即体验: https://usegalaxy.cn
加交流群:请在本文后留言,表明要进交流群,然后加微信 usegalaxy 为好友,拉你进群。
推荐阅读
中国银河生信云平台(UseGalaxy.cn)以“让生信分析更简单”为使命。平台致力于为科研工作者、医疗机构和生物产业技术人员提供全栈式生物信息学分析解决方案。
优先技术响应、定制化工具部署、阶梯式能力培养,请加入「Galaxy生信星球」。咨询微信:usegalaxy 或 galaxy-help

魔乐社区(Modelers.cn) 是一个中立、公益的人工智能社区,提供人工智能工具、模型、数据的托管、展示与应用协同服务,为人工智能开发及爱好者搭建开放的学习交流平台。社区通过理事会方式运作,由全产业链共同建设、共同运营、共同享有,推动国产AI生态繁荣发展。
更多推荐
所有评论(0)