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🌟本文由卿云阁原创!

🌠本阶段属于练气阶段,希望各位仙友顺利完成突破

📆首发时间:🌹2024年3月22日🌹

✉️希望可以和大家一起完成进阶之路!

🙏作者水平很有限,如果发现错误,请留言轰炸哦!万分感谢!


目录

分子特征提取

特征提取

研究现状

FP-GNN

CDK9抑制剂的发现

多任务设计

HiGNN

图神经网络通用框架 —— MPNN消息传递神经网络

分子片段

特征初始化

评测结果:


分子特征提取

特征提取

研究现状


FP-GNN

链接: https://pan.baidu.com/s/1LWBoCnfcVzGZnEkGprBxYQ?pwd=wyy8

提取码: wyy8

给定一个分子,模型会接受这个分子几个方面的信息。

分子图注意网络:分子图的信息,通过图注意网络抓取重要信息,绘制成一个向量。

先验知识神经网络( RNN):使用了三个混合指纹,代表不同的信息。

自适配深度注意力神经网络:把两个信息进行融合

算法评估,在13个公共数据集上进行测试,BASE是一个抗衰老的靶点,HIV是一个偏向于细胞感染的。

                     Mixed FP中蕴藏的信息更能与分子图的信息互补

模型抗噪音能力

模型的可解释性


CDK9抑制剂的发现

Ligand- and structure-based identification of novel CDK9 inhibitors for the potential treatment of leukemia

多任务设计


HiGNN

神经网络通用框架 —— MPNN消息传递神经网络

分子片段

任何化学分子都可以根据16种可合成的化学键环境,断开可合成的单键,产生分子片段。

特征初始化

HiGNN将额外的药效团、分子骨架信息编码进入分子图

评测结果:

分类任务

回归任务

消融实验

注意力分数可视化

可解释性

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