网站自2018年4月16号网站上线，至今，已满2岁。

如果有人告诉你，他要做一个小麦科研有关的网站，两年间访问量为10万+，你相信吗？

不管你信不信，反正我不信。并且，可能打死我，我也不信。

如果你问我最大的感受是什么？

我想到了以前当段子看的互联网企业创业的故事，如比尔盖茨车库建立微软，东哥中关村卖光盘的事等等。以前就是当一个段子来看，没有啥走心的体会。此时此刻，我想也许当初很多不起眼的事，后面会收到意想不到的结果吧。未来的事，谁说的准呢。。。

很多时候，科研也是如此，一个课题开始时，并未想到能有令人印象深刻的结果，但最后竟也能峰回路转，说不定就能上CNS了呢。有的时候，我们对某些课题抱有很大的期望，最终的结果却不如人意。所以，很多事情一开始的判断并不一定都对，只有一点一点做下去才能知道。

我们总希望能够有一个将来有重要产出的课题来开始我们的学术生涯，徘徊，很难选择，就怕选错了。如果实在不知道怎么选，那就从你擅长的开始，一边做，一边看，一旦有了目标，赛道还是可以切换的。

好了，以上就到此为止吧，懂的自然懂。我们题目有“必看”两个字，自然不是要大家进来看这些乱七八糟的感悟的。

更重要的事是介绍最近我们网站的更新。虽然都是些不起眼的小功能，但一定会节省大家的时间，提高效率。

开始之前，问大家几个问题。

1. 5分钟内，你能设计出小麦某个特定位点的KASP或CAPS或dCAPS标记嘛？

1. 看文献看到一个水稻/拟南芥的基因，想要找到小麦中的直系同源基因，2分钟内你能找到嘛？

1. 接上一条，反过来手里有个小麦基因，想要找水稻/拟南芥中的基因，并看看是否已报道。2分钟够嘛？

1. QTL定位到一个30Mb的区间，想要知道参考基因组上有哪些基因，编码什么类型的蛋白，2分钟够嘛？

1. 最近Cell有篇蛋白互作的文章发表(https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.02.049)，想要了解手上的基因是否在数据库中，2分钟够嘛？

1. 想要知道某个基因共表达的基因，2分钟够嘛？

1. 手里有个小麦基因，想要知道其他两个基因组上的部分同源基因，在四倍体/二倍体祖先中的直系同源基因，2分钟够嘛？

1. 想要对某个区间内的基因做共线性分析，2分钟够嘛？要做一个如下图所示的共线性图谱，1个小时够嘛？

以上所有问题都能在小麦多组学网站解决，可能仅仅需要“一东”的时间。其实还有N多方便的功能，由于以前已经介绍过了，篇幅有限这里就不再提示了。花点时间多点点小麦多组学网站的导航栏，会有惊喜的。

今天就着重介绍我们第一个问题，如何快速设计KASP或CAPS/dCAPS标记。

工具入口见上图所示，点击“KASP/CAPS Designer”。进入如下页面

该网页版工具是基于UC Davis的张军利博士的SNP_Primer_Pipeline(https://github.com/pinbo/SNP_Primer_Pipeline)开发的。原本是命令行下运行的程序，我使用过之后就爱不释手了。为了让更多的人方便的使用，经军利博士允许，我们开发了一个web界面来使用这个工具。这样大家只需要按照格式输入自己的SNP位点信息就可以方便使用了。军利博士也开发了一个Galaxy版本(https://galaxy.triticeaetoolbox.org)。

重点说说两个方面。第一个方面是输入格式。csv格式(以英文逗号分隔)。注意一定是英文逗号，其实所有字符都是英文字符。

一行是一个SNP位点，一行包括3列，分别是SNP名字，SNP所在的染色体，SNP上游序列[A/G]SNP下游序列。

另起一行即可输入一个新SNP位点。

第二个方面是输出结果，该如何选择引物。

一般输出结果会有多对引物，该如何选择？一般有以下几个原则。

1. 变异越靠近引物3'端越好

2. 有多个变异

3. 特异性很高，在基因组上只有一个结合位点

4. PCR产物大小，KASP在50-250bp, dCAPS在100-350bp, 一般是150-200bp。

5. 两个引物之间Tm值差异小

6. 引物二聚体少。

以上就是今天的内容。虽然没有啥学术上的价值，但希望对得起“必看”。

后续的功能介绍，敬请期待。