今天,我想向大家介绍一个在医学图像处理领域极具潜力的研究方向——多模态医学图像处理。

这个领域因其在多个应用科学与人工智能的交叉点上的重要性而备受关注,尤其是在医学图像分析中。多模态医学图像处理技术通过整合不同类型的图像数据,能够克服单一成像技术的不足,为我们提供更全面和精确的医学信息,从而显著提升诊断的准确性和治疗的效率。这一技术的应用范围广泛,从癌症诊断到神经科学研究等多个医学领域都有其身影,展现出巨大的发展前景,相关研究成果也层出不穷。

在这个领域中,有许多细分的研究领域值得关注,包括但不限于多模态医学图像的分割、分类、合成、融合以及特征提取等。为了方便大家寻找研究思路和创新点,我特别整理了这些细分领域的最新论文,共有20篇,大多数都附带了代码实现。

三篇论文详解

1、UNROLLED DIFFUSION-GUIDED DEEP IMAGE PRIOR FOR MEDICAL IMAGE RECONSTRUCTION

这篇文章提出了一种结合深度图像先验(Deep Image Prior,简称DIP)和扩散模型(Diffusion Models,简称DMs)的新方法,用于医学图像重建,特别是在磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,简称MRI)和计算机断层扫描(Computed Tomography,简称CT)的应用中。该方法被称为展开的扩散引导的深度图像先验(unrolled Diffusion-Guided DIP,简称uDiG-DIP)。其核心思想是利用DIP网络的输入对重建质量的影响,以及将DMs作为扩散净化器(Diffusion Purifiers,简称DPs)来优化输入。

研究方法:

文章中提出的方法包括以下几个关键步骤:

  • 初始化:使用前向操作符A的逆操作对测量值y进行初始化,得到输入z。

  • 迭代优化:通过K次迭代,在每次迭代中进行N步梯度更新,优化DIP网络的参数θ。

  • 数据一致性与自编码项:优化目标包括数据一致性项和自编码项,旨在减少噪声过拟合。

  • 扩散净化:在每次优化θ后,使用预训练的DMs对输入z进行扩散净化,以确保方法保持扩散净化和输入自适应。

创新点:
  • 结合DIP和DMs:文章首次提出将DIP与DMs结合,以解决DIP在噪声过拟合方面的问题。

  • 扩散净化器(DP):使用预训练的DMs作为DP,通过扩散过程对输入进行净化,以提高图像重建质量。

  • 自适应输入和自编码正则化:通过自适应输入和自编码正则化项,延迟噪声过拟合的开始,提高模型的鲁棒性。

实验结果:

文章通过在fastMRI数据集上的MRI图像重建和在AAPM数据集上的CT图像重建实验,验证了uDiG-DIP方法的有效性。实验结果显示,与现有的基于DIP和基于DM的方法相比,uDiG-DIP在峰值信噪比(PSNR)和结构相似性指数(SSIM)这两个评价指标上都取得了更好的结果。特别是在CT图像重建任务中,uDiG-DIP相比于其他方法实现了近5dB的PSNR提升。

实验验证:

文章通过对比实验,展示了uDiG-DIP在不同迭代次数下对噪声过拟合的鲁棒性。结果表明,与其他方法相比,uDiG-DIP在迭代过程中能够更长时间地维持较高的PSNR值,这表明了其在减少噪声过拟合方面的有效性。此外,文章还展示了不同方法重建的MRI和CT图像的可视化结果,进一步证明了uDiG-DIP在图像质量上的优势。

总结来说,这篇文章通过结合深度图像先验和扩散模型,提出了一种新的医学图像重建方法。该方法通过扩散净化和自编码正则化,有效地解决了噪声过拟合问题,并在MRI和CT图像重建任务中取得了优异的性能。

2、DB-SAM: Delving into High Quality Universal Medical Image Segmentation

这篇文章介绍了一种名为DB-SAM的方法,旨在提高通用医学图像分割的质量。DB-SAM是一种双分支适配的Segmentation Anything Model(SAM)框架,通过并行的两个分支来弥合自然图像与医学2D/3D数据之间的领域差异。

研究方法:

DB-SAM的架构包含两个分支:

  • ViT分支:使用视觉Transformer(ViT)作为编码器,不调整预训练的ViT权重,而是引入了一个局部适配器模块,即在每个ViT注意力块后插入一个可学习的通道注意力块,以捕获特定领域的局部特征。

  • 卷积分支:采用轻量级卷积块直接从输入医学图像中提取特定领域的浅层特征。

为了执行跨分支特征融合,设计了一个双边交叉注意力块和一个ViT卷积融合块,动态结合两个分支的不同信息,用于掩模解码器。

创新点:
  • 双分支编码器:提出了一种新颖的双分支编码器,一个用于捕获局部特征的ViT分支和一个用于提取浅层特征的卷积分支。

  • 通道注意力块:在ViT分支中引入了通道注意力块,增强了模型对医学图像局部特征的捕获能力。

  • 轻量级卷积块:在卷积分支中使用轻量级卷积块,以保留更多的局部细节,有助于提高分割精度。

  • 双边交叉注意力块:设计了用于ViT分支和卷积分支之间有效跨层特征融合的双边交叉注意力块。

  • ViT-卷积融合块:通过自动选择机制融合两个分支的输出特征,使最终的融合输出能够学习到来自ViT分支的全局上下文信息和来自卷积分支的局部空间信息。

实验结果:

在包括21个3D医学图像分割任务的大规模医学图像数据集上的实验表明,DB-SAM与文献中的最近医学SAM适配器相比,实现了8.8%的绝对增益。DB-SAM在3D医学图像分割任务中,与基线MedSAM相比,在DSC和NSD方面分别取得了6%和8.9%的绝对增益。

实验验证:

文章通过在30个公共医学数据集上进行的实验,覆盖了不同模态的2D和3D图像,验证了DB-SAM的有效性。实验结果表明,DB-SAM在多种2D和3D医学分割任务上的性能一致提高。特别是在涉及小器官和轮廓复杂的器官的复杂3D任务中,DB-SAM表现出色。

结论:

文章提出的DB-SAM通过双分支图像编码器,有效地提取了医学图像的高低层次领域特定特征。通过在大规模医学图像分割数据集上的实验,证明了所提出方法的优越分割性能。

3、Optimizing Medical Image Segmentation with Advanced Decoder Design

这篇文章介绍了一种改进的医学图像分割网络,名为Swin DER,专注于优化解码器(decoder)设计,以提高分割细节的优化能力。Swin DER基于Swin UNETR,通过具体优化解码器的三个关键部分:上采样(upsampling)方法、跳跃连接(skip connection)和特征提取模块,从而提升医学图像分割的性能。

研究方法:
  • 上采样方法(Onsampling):提出了一种新颖的上采样算法,称为偏移坐标邻域加权上采样(Offset coordinate neighborhood weighted upsampling),它通过学习位置偏移和像素权重来优化插值算法,增强了算法的灵活性,有效避免了转置卷积中的棋盘格伪影。

  • 跳跃连接(Spatial-Channel Parallel Attention Gate, SCP AG):引入了空间-通道并行注意力门,通过在跳跃连接中并行引入空间和通道注意力门,消除跳跃连接中的不相关和噪声响应。

  • 特征提取模块(Deformable Squeeze-and-Attention, DSA Block):在解码器的特征提取模块中引入了可变形卷积和注意力机制,通过可变形卷积进一步学习详细的特征,并通过注意力机制关注特征图中的重要部分。

创新点:
  • Onsampling:该算法通过学习的方式动态调整子像素位置,使插值算法的权重可学习,与传统的基于固定规则的插值算法相比,更加灵活和适应性强。

  • SCP AG:通过在跳跃连接中引入空间和通道两个维度的注意力机制,更有效地结合编码器和解码器的特征,减少了它们之间的语义差距。

  • DSA Block:结合了可变形卷积和注意力机制,使解码器能够自适应地调整其感受野,同时关注更重要的特征,增强了特征提取和学习的能力。

实验结果:

文章通过在Synapse多器官分割数据集和MSD脑肿瘤分割任务上的实验,验证了Swin DER的有效性。在Synapse数据集上,Swin DER在平均DSC(Dice Similarity Coefficient)和平均HD95(Hausdorff 95 distance)两个评价指标上均取得了最佳性能。与基线模型Swin UNETR相比,平均DSC提高了4.41%,平均HD95降低了9.55mm。在MSD脑肿瘤分割任务中,Swin DER同样在平均DSC和HD95上取得了最佳性能,与Swin UNETR相比,平均DSC提高了1.25%,平均HD95降低了0.14mm。

实验验证:

文章通过消融实验进一步验证了所提出的各个组件的有效性。实验结果表明,Onsampling、SCP AG和DSA Block在单独使用时都能显著提升分割性能,而当这些组件结合在一起时,可以进一步提升性能,证明了这些组件在优化解码器方面的有效性。

结论:

文章提出的Swin DER通过优化解码器的关键组件,显著提高了医学图像分割的性能。通过引入创新的上采样算法、注意力机制和可变形卷积,Swin DER在处理复杂医学图像分割任务时,展现了优越的分割能力和细节优化能力。

如何学习大模型 AI ?

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  • 大模型 AI 能干什么?
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  • 用好 AI 的核心心法
  • 大模型应用业务架构
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  • 代码示例:向 GPT-3.5 灌入新知识
  • 提示工程的意义和核心思想
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  • 指令调优方法论
  • 思维链和思维树
  • Prompt 攻击和防范

第二阶段(30天):高阶应用

该阶段我们正式进入大模型 AI 进阶实战学习,学会构造私有知识库,扩展 AI 的能力。快速开发一个完整的基于 agent 对话机器人。掌握功能最强的大模型开发框架,抓住最新的技术进展,适合 Python 和 JavaScript 程序员。

  • 为什么要做 RAG
  • 搭建一个简单的 ChatPDF
  • 检索的基础概念
  • 什么是向量表示(Embeddings)
  • 向量数据库与向量检索
  • 基于向量检索的 RAG
  • 搭建 RAG 系统的扩展知识
  • 混合检索与 RAG-Fusion 简介
  • 向量模型本地部署

第三阶段(30天):模型训练

恭喜你,如果学到这里,你基本可以找到一份大模型 AI相关的工作,自己也能训练 GPT 了!通过微调,训练自己的垂直大模型,能独立训练开源多模态大模型,掌握更多技术方案。

到此为止,大概2个月的时间。你已经成为了一名“AI小子”。那么你还想往下探索吗?

  • 为什么要做 RAG
  • 什么是模型
  • 什么是模型训练
  • 求解器 & 损失函数简介
  • 小实验2:手写一个简单的神经网络并训练它
  • 什么是训练/预训练/微调/轻量化微调
  • Transformer结构简介
  • 轻量化微调
  • 实验数据集的构建

第四阶段(20天):商业闭环

对全球大模型从性能、吞吐量、成本等方面有一定的认知,可以在云端和本地等多种环境下部署大模型,找到适合自己的项目/创业方向,做一名被 AI 武装的产品经理。

  • 硬件选型
  • 带你了解全球大模型
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  • 搭建 OpenAI 代理
  • 热身:基于阿里云 PAI 部署 Stable Diffusion
  • 在本地计算机运行大模型
  • 大模型的私有化部署
  • 基于 vLLM 部署大模型
  • 案例:如何优雅地在阿里云私有部署开源大模型
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学习是一个过程,只要学习就会有挑战。天道酬勤,你越努力,就会成为越优秀的自己。

如果你能在15天内完成所有的任务,那你堪称天才。然而,如果你能完成 60-70% 的内容,你就已经开始具备成为一名大模型 AI 的正确特征了。

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魔乐社区(Modelers.cn) 是一个中立、公益的人工智能社区,提供人工智能工具、模型、数据的托管、展示与应用协同服务,为人工智能开发及爱好者搭建开放的学习交流平台。社区通过理事会方式运作,由全产业链共同建设、共同运营、共同享有,推动国产AI生态繁荣发展。

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