使用schrodinger建立QSAR模型

本篇教程将展示如何使用AutoQSAR/DeepChem去设定,建立和理解深度学习QSAR/QSPR模型.

文章目录

一、深度学习QSAR模型是什么？

定量构效关系（QSAR）指的是利用数理统计方法建立特定性质与分子的理化性质参数或结构参数之间关系的方法,而深度学习则是数理统计方法中的最为强大的方法之一.深度学习QSAR模型的主要优势在于完全由数据驱动,当数据量越大,模型的能力就越强.

二、使用步骤

文件名显示为如右格式:1fjs.pdb
需要点击或输入则显示为如右格式:File > Import Structures

1.创立项目引入结构

在这里插入图片描述

2.建立一个AutoQSAR/DeepChem 模型以预测污染物致突变性.

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

3.分析和使用AutoQSAR/DeepChem 污染物致突变性模型

3.1 分析

在这里插入图片描述

3.2 使用

在这里插入图片描述

4.分析来自AutoQSAR / Deepchem模型的Ames致突变性的预测结果

4.1 确定分类阈值

在这里插入图片描述

4.2 预处理数据做混淆矩阵分析

在这里插入图片描述

4.3 混淆矩阵分析

在这里插入图片描述

# 深度学习
Logo
魔乐社区

魔乐社区（Modelers.cn) 是一个中立、公益的人工智能社区，提供人工智能工具、模型、数据的托管、展示与应用协同服务，为人工智能开发及爱好者搭建开放的学习交流平台。社区通过理事会方式运作，由全产业链共同建设、共同运营、共同享有，推动国产AI生态繁荣发展。

更多推荐

cover

量化挑战赛冠军专访：4小时啃下W4A8量化，我靠的是这些经验

avatar 魔乐社区
cover

替你试过了，消费级显卡可以跑的开源文生图SOTA模型，顶级渲染、高密度文本绘图

avatar 魔乐社区
cover

「极限压缩 量化未来」Modelers GeekDay上海站圆满落幕

avatar 魔乐社区