静息态功能磁共振成像(rs-fMRI )数据分析基础2——认识数据与图像
在选择一个想要查看的时间点后会打开该时间点的图像,上方的X、Y、Z为当前点击的体素位置,下方的38x11x51 = 89076.09表示,这个坐标体素的信号值为89076.09,因为采集了240个时间点,因此每个坐标体素都有240个信号值,将其连接起来,即可得到该坐标体素在扫描时间范围的BOLD信号波动情况,即代表了该区域神经元的活动情况。Window-Information选项可查看图像的一些基
从工作站中导出的数据一般为每个被试下包含多个文件夹,其中每个文件夹代表一个扫描序列。
每个文件夹内包含有这个序列的所有dicom原始文件,一般以每一层一个dicom文件的格式组织,因此会有很多文件。

在使用dcm2niix等工具将其转换为nii格式后,每个序列的所有dicom文件都将被整合为一个nii文件,一般来说,无论是查看数据还是进行数据处理前都需要先进行转nii。

nii文件可使用MRIcron等软件打开,查看数据质量、数据的一些基本扫描参数等。、
使用MRIcron软件打开fmri图像时会弹出窗口,询问用户想查看哪个时间点的图像(有关于时间点的知识可查看数据分析基础1),示例文件为扫描了240个时间点的fmri图像。

在选择一个想要查看的时间点后会打开该时间点的图像,上方的X、Y、Z为当前点击的体素位置,下方的38x11x51 = 89076.09表示,这个坐标体素的信号值为89076.09,因为采集了240个时间点,因此每个坐标体素都有240个信号值,将其连接起来,即可得到该坐标体素在扫描时间范围的BOLD信号波动情况,即代表了该区域神经元的活动情况。

Window-Information选项可查看图像的一些基本信息,例如图像的扫描体素大小为3.5x3.5x3.5,扫描次数为240次等。


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