开篇放问题：训练颅骨剥离模型，明明尺寸几乎都成比例了，就差那么一圈，仿射矩阵就差那么一点，这数据和标签死活配不准，啥算法都不准，一配就出大问题。
开篇放解决办法：直接无脑用0值填充标签边缘使得它与原始数据对齐就可以了。我想明白原理以后直呼弱智。我的任务是颅骨剥离，那数据集就是带颅骨的，标签就是不带的，标签那么大一圈颅骨没了，你觉得少圈颅骨尺寸能一样吗？又是黑黑白白二值图像，你觉得强行缩放也好，simpleITK也好ANTS也好Flirt也好，就算真误打误撞配准了，标签上又分不清是不是颅骨，后头训练能好吗？

第一，简单说两句数据集：
OASIS-1，MRI结构像数据集，包含了416名从老到小的被试的脑子。
原始数据：每个被试者的RAW文件里头包含4张或者三张图。注意，原始数据和标签的所处空间不一致，一定要立马拿去和MNI152 1mm模板配准了。$FSLDIR/data下自带的MNI152 1mm模板。
标签：每个被试者的FSL_SEG文件里头包含的，基于FSL BET剥过颅骨的，配准到MNI152 1mm模板的4值标签，0是空气，1是脑脊液，2是灰质，3是白质。

第二，简单介绍下我想做啥。
我正在用非公开数据集做一个脑MRI项目，被预处理里头的颅骨剥离手动调参麻烦得整破防了，想自己训个模型出来帮我剥。俺用的就是FSL，所以特意挑了个标签就是FSL处理的。

第三，当时遇到了啥问题？
我没有留当时的截图。一句话，配准出了大问题。在我把原始数据也用MNI152 1mm模板把原始数据配过去之后，这标签图和原始数据邪了门了死活配不准，哪怕是我给原始数据也用MNI152 1mm模板配过了也配不准。SimpleITK把有效脑区像素砍没了，ANTS把脑子快配成松树了（原谅ANTS把，二值图像啥细节也没有让他配准也难为它了），哪怕用FSL自家的FLIRT都配不准。

第四，咋解决的？
无脑用0值填充标签边缘使得它与原始数据对齐。解决效果极好，我根本没对仿射矩阵动手，它自己就和数据完全一致了。

问题解决了好几个小时才记录的，很可惜没有留图了。