python进行异常检测工具_用PyOD工具库进行「异常检测」
异常检测 (又称outlier detection、anomaly detection,离群值检测) 是一种常见的数据挖掘方法 , 主要被用于检测与主要数据分布不同的异常值 (deviant from the general data distribution),比如从信用卡交易中找出诈骗案例,从正常的网络数据流中找出入侵,有非常广泛的商业应用价值。另一个常见的用途就是作为机器学习任务的预处理(p
异常检测 (又称outlier detection、anomaly detection,离群值检测) 是一种常见的数据挖掘方法 , 主要被用于检测与主要数据分布不同的异常值 (deviant from the general data distribution),比如从信用卡交易中找出诈骗案例,从正常的网络数据流中找出入侵,有非常广泛的商业应用价值。另一个常见的用途就是作为机器学习任务的预处理(preprocessing),防止因为少量异常点存在而导致的训练或预测失败。
Python Outlier Detection(PyOD) 是当下最流行的Python异常检测工具库(toolkit),其主要亮点包括:
包括近20种常见的异常检测算法,比如经典的ABOD以及最新的 深度学习 如对抗生成模型(GAN)和 集成异常检测 (outlier ensemble)
支持不同版本的Python :包括2.7和3.5+; 支持多种操作系统 :windows,macOS和Linux
简单易用且一致的API , 只需要几行代码就可以完成异常检测 ,方便评估大量算法
使用JIT和并行化(parallelization)进行优化,加速算法运行及扩展性(scalability),可以处理大量数据
从2018年5月正式发布以来, PyOD 已经获得了超过50000次下载与1400个GitHub Star,在所有GitHub数据挖掘(data mining)工具库[1]中排名14 。同时它也被运用于多项学术研究中[2, 3]。我也曾在回答中使用过 PyOD :「 数据挖掘中常见的「异常检测」算法有哪些? 」。 因为现阶段 PyOD 的文档与实例全部为英文,为了方便大家使用,特别专门创作了这篇中文使用指南,欢迎转载 。
1. 背景概览(package overview)
PyOD 提供了约20种异常检测算法(详见图1),部分算法介绍可以参考「 数据挖掘中常见的「异常检测」算法有哪些? 」或异常检测领域的经典教科书[4]。同时该工具库也包含了一系列辅助功能,包括数据可视化及结果评估等:
图1. PyOD中所包括的算法一栏
工具库相关的重要信息汇总如下:
Github地址: pyod
PyPI下载地址: pyod
文档与API介绍(英文) : Welcome to PyOD documentation!
Jupyter Notebook示例(notebooks文件夹) :Binder (beta)
JMLR论文(在审): PyOD: A Python Toolbox for Scalable Outlier Detection
PyOD 提供两种非常简单的安装方法。我个人推荐使用pip进行安装:
pip install pyod
GitHub安装: pyod
PyPI安装:pyod
使用其包含的算法也很简单:每个算法均有相对应的例子,方便使用者学习了解API( 示例文件夹 ),比如LOF算法的对应例子就叫做lof_example.py,非常容易找到。除此之外,作者还提供了 可互动的Jupyter Notebook示例 ,无需安装,直接从浏览器打开notebook就可以尝试 PyOD 工具库。
2. API介绍与实例(API References & Examples)
特别需要注意的是, 异常检测算法 基本都是 无监督学习 ,所以只需要X(输入数据),而不需要y(标签)。 PyOD 的使用方法和Sklearn中聚类分析很像,它的检测器(detector)均有统一的API。所有的 PyOD 检测器clf均有统一的API以便使用,完整的API使用参考可以查阅( API CheatSheet - pyod 0.6.8 documentation ):
fit(X) : 用数据X来“训练/拟合”检测器clf。即在初始化检测器clf后,用X来“训练”它。
fit_predict(X) : 和fit函数相似。先使用数据X训练检测器clf,再返回X的二分类标签(0为正常点,1为异常点)
fit_predict_score(X, y) : 用数据X来训练检测器clf,并预测X的预测值,并在真实标签y上进行评估。此处的y只是用于评估,而非训练
decision_function(X) : 在检测器clf被fit后,可以通过该函数来预测未知数据的异常程度,返回值为原始分数,并非0和1。返回分数越高,则该数据点的异常程度越高
predict(X) : 在检测器clf被fit后,可以通过该函数来预测未知数据的异常标签,返回值为二分类标签(0为正常点,1为异常点)
predict_proba(X) : 在检测器clf被fit后,预测未知数据的异常概率,返回该点是异常点概率
当检测器clf被初始化且fit(X)函数被执行后,clf就会生成两个重要的属性:
decision_scores : 数据X上的异常打分,分数越高,则该数据点的异常程度越高
labels_ : 数据X上的异常标签,返回值为二分类标签(0为正常点,1为异常点)
不难看出,当我们初始化一个检测器clf后,可以直接用数据X来“训练”clf,之后我们便可以得到X的异常分值(clf.decision_scores)以及异常标签(clf.labels_)。当clf被训练后(当fit函数被执行后),我们可以使用decision_function()和predict()函数来对未知数据进行训练。
在有了背景知识后,我们可以使用PyOD来实现一个简单的异常检测实例:
from pyod.models.knn import KNN # imprt kNN分类器
# 训练一个kNN检测器
clf_name = 'kNN'
clf = KNN() # 初始化检测器clf
clf.fit(X_train) # 使用X_train训练检测器clf
# 返回训练数据X_train上的异常标签和异常分值
y_train_pred = clf.labels_ # 返回训练数据上的分类标签 (0: 正常值, 1: 异常值)
y_train_scores = clf.decision_scores_ # 返回训练数据上的异常值 (分值越大越异常)
# 用训练好的clf来预测未知数据中的异常值
y_test_pred = clf.predict(X_test) # 返回未知数据上的分类标签 (0: 正常值, 1: 异常值)
y_test_scores = clf.decision_function(X_test) # 返回未知数据上的异常值 (分值越大越异常)
不难看出, PyOD 的API和scikit-learn非常相似,只需要几行就可以得到数据的异常值 。当检测器得到输出后, 我们可以用以下代码评估其表现,或者直接可视化分类结果( 图2 ) 。
# 评估预测结果
print("\nOn Test Data:")
evaluate_print(clf_name, y_test, y_test_scores)
# 可视化
visualize(clf_name, X_train, y_train, X_test, y_test, y_train_pred,
y_test_pred, show_figure=True, save_figure=False)
图2. 预测结果(右图)与真实结果(左图)对比
3. 相关教程、资源与未来计划
除此之外,不少网站都曾提供过如何使用PyOD的教程,比较权威的有:
Analytics Vidhya : An Awesome Tutorial to Learn Outlier Detection in Python using PyOD Library
KDnuggets : Intuitive Visualization of Outlier Detection Methods
awesome-machine-learning : General-Purpose Machine Learning
根据开发团队的计划( Todo & Contribution Guidance ),很多后续功能会被逐步添加:
支持GPU运算
支持conda安装
增加中文文档
除此之外, 开发团队也整理异常检测相关的资源汇总(课程、论文、数据等) ,非常值得关注: anomaly-detection-resources
总结来看, PyOD 是当下最为流行的异常检测工具库,且处于持续更新中 。建议大家尝试、关注并参与到 PyOD 的开发当中。有鉴于功能可能会不断更新,请以GitHub版本为准。
[1] Build software better, together
[2] Ramakrishnan, J., Shaabani, E., Li, C. and Sustik, M.A., 2019. Anomaly Detection for an E-commerce Pricing System. arXiv preprint arXiv:1902.09566.
[3] Zhao, Y., Hryniewicki, M.K., Nasrullah, Z., and Li, Z. LSCP: Locally Selective Combination of Parallel Outlier Ensembles. SIAM International Conference on Data Mining (SDM) . 2019.
[4] Aggarwal, C.C., 2015. Outlier analysis. In Data mining . Springer, Cham.
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