直说主题,用mega软件的Alignment功能导入了氨基酸肽段序列信息后,保存为FASTA格式。

截取了部分

 导入WEBLOGO3页面,output选项当中,只有EPS和Data格式是可以点击的。

 旧版本的weblogo,只可以画出bits的效果

想要达到下图的probability的话只能用weblogo3,虽然可以利用r语言跑代码绘画,奈何本人代码实力堪忧。 

而且weblogo3导出的EPS格式也没法打开,又因为数据是蛋白序列,不像核酸序列因子那么少。 不知道站内各位高手有无解决办法,或者简洁一点的代码。

Logo

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