原标题：ClueGO生信作图进阶技巧及实操演示

在之前的文章中，给大家介绍了ClueGO的基本使用方法()，今天给大家介绍一些进阶用法和实操演示。

在先前介绍过的一篇生信文章中()有这么一张图，图中展示了miRNA的靶基因所对应的信号通路，非常直观地展示了miRNA可能对哪些信号通路产生了影响。

下面本宫介绍一下这张图的作图方法。

首先选择CluePedia功能，然后输入两个miRNA的名字，Start！

选中这两个miRNA，利用miTarBase数据库(这个数据库不在默认列表里，点旁边的下载选项可以下载该数据库)进行分析。

然后选择ClueGO功能，Ctrl+A选中所有基因，选择导入network，将刚才分析出来的所有基因导入到表中，选择KEGG分析，并设置成只显示pV<0.05的通路以及富集结果至少包含2个基因。

选择显示基因

但结果中并没有包含miRNA

我们还需要添加两个miRNA

然后再选中这两个miRNA，用miTarBase数据库将miRNA与刚才筛选出来的靶基因进行关联(我们前面的步骤实际上是一个筛选靶基因的过程)。

最后，见证奇迹的时刻~~

当然了，为了展示的更加清楚，网络图还可以进行美化调整，这里就不做演示了。

ClueGO中另一个常用的关联数据库是STRING数据库， 在下面这张图中，我们还可以添加STRING数据库的分析结果。我们选中Bladder cancer相关的基因进行分析。

相互间作用类型，相关阈值以及基因数量都是可以自己设置的。这里本宫选择了Activation和Inhibition两项。

最后画出来是这样的：

ClueGO当中还有许多其它数据库可以使用，目前一共有26个数据库。

此外ClueGO也是有许多其它外链可以使用的

今天就策到这里了，大家如果在别的文章中有看到利用ClueGO做出来的网络图也可以在本文下面留言，本宫会尽可能给大家展示重现的过程。最后还请大家多多给X湿兄的讲座捧个场！

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